如何测量RNA的纯度和含量

kuaidi.ping-jia.net  作者:佚名   更新日期:2024-07-12
如何测量RNA浓度

1、超微量分光光度计测260nm吸收值计算。
可以定量溶于缓冲液的寡核苷酸,单链、双链DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波长260 nm。
2、也可以用RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。

扩展资料
1、RNA的功能是:
(1)具有肽酰转移酶的活性。
(2)为tRNA提供结合位点。
(3)在蛋白质合成起始时,参与同mRNA选择性的结合,在肽链的延伸中与mRNA结合。
2、原核生物的rRNA分三类:5SrRNA、16SrRNA和23SrRNA。
真核生物的rRNA分四类:5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA。
S为大分子物质在超速离心沉降中的一个物理学单位,可间接反映分子量的大小。原核生物和真核生物的核糖体均由大、小两种亚基组成。
3、凝胶成像对DNA或RNA胶 进行切胶、拍照、观察、分析的实验室类仪器,凝胶成像系统可以应用于分子量计算、密度扫描、密度定量、PCR定量等生物工程常规研究。
参考资料来源:百度百科—核糖体RNA
参考资料来源:百度百科—超微量分光光度计
参考资料来源:百度百科—凝胶成像
参考资料来源:百度百科—RNA GEL SHIFT

如果根据紫外线分光光度法,将测到他和她用户这个还是可以有专业的分析师根据籽的这个分析一汽,进行分析。
A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释bai或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有悬浮物等)影响。
DNA样品的A260 吸光度值是否>0.1。(请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1)。

扩展资料:
A260/A280是核酸纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7-8.5 下其比值应该在2.0 或2.5,A260 / A280的比值, 用于评估样品的纯度, 因为蛋白的吸收峰是280 nm。 纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。
参考资料来源:百度百科-OD260/280比值

RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。

凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。RNA-seq即转录组测序技术,把mRNA,smallRNA等用高通量测序技术把RNA的序列测出来。反映出RNA的表达水平。

RNA纯度:RNA在纯化过程中容易受到DNA、蛋白质及有机溶剂的影响,这些残存物将会影响以后的操作。光谱分析(NANODROP)利用物质对不同波长光的吸收度的不同,可以鉴别出溶液纯度及浓度。

组成结构

RNA和DNA一样,也是由各种核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接构成的多核苷酸链,但与DNA有一系列差异。 

在化学组成方面,RNA含核糖而不含脱氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每个tNA分子含有一个胸腺嘧啶,这是在RNA链合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少数DNA含有少量核糖,但这些个别的例外并不能以此否定两类核酸组成上的差异。

以上内容参考:百度百科-核糖核酸



1. 相关概念
RNA质检参数OD260/OD280、OD260/OD230的意义。

260、280、320、230nm下的吸光度分别代表了核酸、蛋白质、盐浓度和有机溶剂的值。

A230: 测定其它碳源物质,如酚,糖类等。

A260:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA,引物等的浓度用的。

A280:蛋白质的吸收峰。

一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)在1.8~2.1范围内时,我们认为 RNA中蛋白的污染是可以容忍的,不过要注意,当用 Tris 作为缓冲液检测吸光度时,R 值可能会大于 2(一般应该是<2.2的)。当R < 1.8时,溶液中蛋白的污染比较明显,可以根据自己的需要决定这份RNA 的命运。当R > 2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。纯RNA的OD260/OD280的比值为2.0。

2. RNA质量检验
RNA样品的品质检测一般分为总量,纯度与完整性三大项。

总量:微量分光光度计测260nm吸收值计算。

纯度:微量分光光度计测260nm/230nm吸收值的比值,用于评估有机溶剂残留;260nm/280nm吸收值的比值,用于评估蛋白质污染比例。

完整性:以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性最好,0为最差。

l RNA纯度

RNA在纯化过程中容易受到DNA、蛋白质及有机溶剂的影响,这些残存物将会影响以后的操作。光谱分析(NANODROP)利用物质对不同波长光的吸收度的不同,可以鉴别出溶液纯度及浓度。RNA溶液的A260/A280的比值是一种RNA纯度检测方法,比值范围一般为1.8-2.1。各项实验对RNA纯度要求不一,比如即使比值超出这个范围,RNA样品也一样可以用于一些普通实验中,如Northern杂交、RT-PCR、荧光定量PCR和RNA酶保护等实验。

章台夜思(韦庄)

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    答:凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。RNA-seq即转录组测序技术,把mRNA,smallRNA等用高通量测序技术把RNA的序列测出来。反映出RNA的表达水平。RNA纯度:RNA在纯化过程中容易受到DNA、蛋白质及...
  • 加入你从某动物组织提取了一份总RNA,可采用一些什么方法检测它的质量...
    答:凝胶电泳检测DNA和蛋白污染,以及是否有降解,初步观测28S:18S ;Nanodrop,初步测浓度,260比280,260比230 Qubit可以精确定量 还有一种安捷伦2100的机器,可以测得更精准的指标,会有一个图以及一个模拟电泳出来,能得到RIN值什么的,目前最尖端的方法就是这四种了 ...
  • 检测核酸纯度方法
    答:寡核苷酸的含量为30μg/ml,可以据此来计算核酸样品的浓度,还可通过测定在260nm和280nm的OD值的比值 (OD260/OD280),估计核酸的纯度。纯净DNA的比值为1.8, RNA为2.0。若比值高于1.8说明DNA样品中的RNA尚未除 尽,若样品中含有酚和蛋白质将导致比值降低。270nm存在高吸收表明有酚的干扰。 紫外...
  • 如何测量RNA浓度
    答:2、也可以用RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。
  • 4.如何检测、评价提取的DNA、RNA质量?如何计算提取的DNA、RNA浓度?
    答:一般通过OD260/OD280来判断他们的含量,纯DNA的比值一般在1.8,大于1.8,小于2时可能有RNA污染,在1.9到2.0时RNA纯度高,小于1.8时可能有蛋白质污染,大于2.0时可能在提取过程中的化学物质残留。提取原则 1、保证核酸一级结构的完整性。2、核酸样品中不应存在对酶有抑制作用的有机溶剂和过高...
  • 如何鉴定新提取细胞rna的质量纯度浓度
    答:可以用紫外光的吸光度来测量浓度,260/280的比值看质量,最好是大于2,还有跑胶看有没有降解
  • 如何根据紫外线分光光度法检测的RNAA260和A280结果分析RNA浓度与纯度...
    答:如果根据紫外线分光光度法,将测到他和她用户这个还是可以有专业的分析师根据籽的这个分析一汽,进行分析。A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释bai或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有...
  • 测dna和rna用什么方法比较好?
    答:A260/A280和A260/A230是核酸纯度的指示值。纯度好的DNA或RNA,在pH7-8.5下A260 / A280的比值应该在2.0 或2.5。纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0 。当 0.5%BSA蛋白质污染...
  • DNA和RNA纯度检测的问题!
    答:对于纯的样品只要读出260 nm 的A值即可以算出含量。通常以A值为1相当于50微克/ml 双螺旋DNA,或者40微克/ml 单链DNA(RNA),或者20微克/ml 寡核苷酸计算。OD260/OD280=1.9~2.0 RNA居多,纯度已经很高了。纯DNA:OD260/OD280≈1.8(>1.9,表明有RNA污染;<1.6,表明有蛋白质、酚等污染...
  • 如何检测RNA提取成功或如何检测RNA的完整性
    答:如mRNA制备中的rRNA污染)的评估。在过去,检测浓度及纯度需要使用部分RNA样品(通过A260分光光度法),而评估完整性则需要另外使用部分样品。通过使用LabChip®系统,可以仅使用一份5ng的样品来同时对浓度、完整性及纯度进行分析。分析数据可以显示为类凝胶图像、电泳峰图及表格形式等。