如何测量RNA浓度

kuaidi.ping-jia.net  作者:佚名   更新日期:2024-08-06
如何测RNA浓度

我觉得还行吧,我做RT-PCR也是提取了RNA之后测一下浓度就好了,不跑胶.后面的PCR也能做出来.

提取细胞RNA之后,为什么要测RNA浓度
1、提取RNA测浓度时 A260/A280 大于3的原因可能是降解。
2、一般对于DNA,纯净的时候比值是1.8,而对于RNA则是接近2.0。如果超过这个值,那么最有可能的就是核酸降解了,因为寡聚的核酸和核苷酸在260的吸收峰比长链核苷酸要大,所以会使比值上升。RIN(RNA Integrity Number):RNA完整性计数,看你的RNA是不是完整,质量好不好,太低就说明降解严重~~~ 其实提取RNA的条件没那么苛刻,在普通的通风橱里就可以操作,外源RNase的污染比较好消除,关键是破壁时的内源降解。如果用trizol法就必须考虑trizol的量。 另外,相同的方法提取不同细菌的RNA效果也不一样。比如霍乱用trizol法提取效果极差,而沙门菌提取效果就较好;所以霍乱菌最好是用试剂盒过柱子提取,然后浓缩。我提取的是大肠杆菌,摸索了好几种方法,最后确定也是qiagen 的kit提取,然后浓缩。 另外,有一种可以喷的液体,叫做RNase抑制剂,用于消除表面RNase的污染,在客观条件不是很好的时候很有效。

1、超微量分光光度计测260nm吸收值计算。

可以定量溶于缓冲液的寡核苷酸,单链、双链DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波长260 nm。

2、也可以用RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。

扩展资料

1、RNA的功能是:

(1)具有肽酰转移酶的活性。

(2)为tRNA提供结合位点。

(3)在蛋白质合成起始时,参与同mRNA选择性的结合,在肽链的延伸中与mRNA结合。

2、原核生物的rRNA分三类:5SrRNA、16SrRNA和23SrRNA。

真核生物的rRNA分四类:5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA和28SrRNA。

S为大分子物质在超速离心沉降中的一个物理学单位,可间接反映分子量的大小。原核生物和真核生物的核糖体均由大、小两种亚基组成。

3、凝胶成像对DNA或RNA胶 进行切胶、拍照、观察、分析的实验室类仪器,凝胶成像系统可以应用于分子量计算、密度扫描、密度定量、PCR定量等生物工程常规研究。

参考资料来源:百度百科—核糖体RNA

参考资料来源:百度百科—超微量分光光度计

参考资料来源:百度百科—凝胶成像

参考资料来源:百度百科—RNA GEL SHIFT



一般通过总量,纯度与完整性三大项检测来确认RNA质量:
1总量:微量分光光度计测260nm吸收值计算。
2纯度:微量分光光度计测260nm/230nm吸收值的比值,用于评估有机溶剂残留;260nm/280nm吸收值的比值,用于评估蛋白质污染比例。
3完整性:以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性最好,0为最差。

RNA质检参数中260、280、320、230nm下的吸光度分别代表了核酸、蛋白质、盐浓度和有机溶剂的值。其中:

A230: 测定其它碳源物质,如酚,糖类等。
A260:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA,引物等的浓度用的。
A280:蛋白质的吸收峰。
一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)在1.8~2.1范围内时,我们认为 RNA中蛋白的污染是可以容忍的,不过要注意,当用 Tris 作为缓冲液检测吸光度时,R 值可能会大于 2(一般应该是<2.2的)。当R 1.8时,溶液中蛋白的污染比较明显,可以根据自己的需要决定这份RNA 的命运。当R > 2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了,而纯RNA的OD260/OD280的比值为2.0。

  • 如何鉴定新提取细胞rna的质量纯度浓度
    答:可以用紫外光的吸光度来测量浓度,260/280的比值看质量,最好是大于2,还有跑胶看有没有降解
  • 细胞RNA提取之后,如何定量?
    答:用溶解RNA的溶剂作为空白对照,测OD260,1个OD260值相当于40μg/ml RNA。同时可以看一下OD260/OD280的值,如果在2.0左右说明RNA质量较高。其实,如果不是要做实时定量分析,反转录过程中对RNA浓度的要求不高,可以多加一点保证RNA过量。一般也不会影响实验结果。
  • 如何对提取的RNA样品进行定量和定性检测
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  • 加入你从某动物组织提取了一份总RNA,可采用一些什么方法检测它的质量...
    答:凝胶电泳检测DNA和蛋白污染,以及是否有降解,初步观测28S:18S ;Nanodrop,初步测浓度,260比280,260比230 Qubit可以精确定量 还有一种安捷伦2100的机器,可以测得更精准的指标,会有一个图以及一个模拟电泳出来,能得到RIN值什么的,目前最尖端的方法就是这四种了 ...
  • 如何用RT-qPCR检测RNA浓度?
    答:提出来RNA之后可以测一个od值,然后可以计算出质量。1OD=33微克。相应的加入稀释液就可以知道浓度了。不知道是不是你想要的答案,因为我曾经在这里迷茫了很久。。。呵呵
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    答:2. 扫基线,按程序下放的"baseline"(此时不放样品) 3. 打开Configure菜单,点击Parmeters,根据实际情况设定参数(如扫描范围,步进,扫描速率等等) 4. 测量,按start键,进行测量 5.峰位置的确定: (1) 电脑确定:点击"Manipnlate"菜单中"Peak Pick"项,出现一对话框,将光标移至对话框最上方(...
  • 测的RNA浓度的单位是什么
    答:测的RNA浓度的单位是µg/ml。一般是按照1OD=40µg/ml计算RNA浓度。你将2µl样品稀释到200µl,稀释倍数就是100倍,所以你提取的RNA浓度=0.154×100×40µg/ml=616µg/ml。因为你RNA的量是50µl,所以你提取的RNA总量=616µg/ml×50/1000ml...
  • 分光光度计A260是什么意思?
    答:A260:A230是分光光度计测量RNA溶液的浓度出现的数值,表示样品的纯度。1、A260nm:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA等的浓度用的。260nm是核酸分子吸收峰的波长,是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查...
  • ...线分光光度法检测的RNAA260和A280结果分析RNA浓度与纯度?
    答:如果根据紫外线分光光度法,将测到他和她用户这个还是可以有专业的分析师根据籽的这个分析一汽,进行分析。A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释bai或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有...
  • 知道OD260怎么算RNA 的浓度呀?提取的RNA总量怎么算?
    答:RNA浓度通常计算为1OD =40μg/ ml。将2μl样品稀释至200μl,稀释倍数为100x,因此提取的RNA浓度为0.154×100×40μg/ ml =616μg/ ml。由于RNA量为50μl,提取的RNA总量为616μg/ ml×50 / 1000ml =30.8μg。