如何判断提取质粒DNA的纯度

kuaidi.ping-jia.net  作者:佚名   更新日期:2024-08-06
如何判断提取的DNA是高纯度的双链DNA

首先:可以通过分光光度计
A 260 / A 280的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是 280 nm.纯净的样品,比值大于 1.8(DNA)或者2.0(RNA).如果比值低于 1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响.A 230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,较纯净的核酸 A 260 / A 230 的比值大于 2.0.A 320检测溶液的混浊度和其他干扰因子.纯样品,A 320 一般是 0.
若要判断完整性--可以先做琼脂糖凝胶电泳,再做限制酶切(要求更高)

紫外分光光度计定量。
方法用大肠杆菌DH5α感受态细胞克隆丰量的pMD-18T重组质粒,紫外分光光度计定量后,根据重组质粒分子量计算其拷贝数,稀释成梯度浓度的荧光实时定量PCR的标准品,取1.0×106、1.0×104和1.0×102拷贝/μl高中低3个浓度的标准品,反复冻融1、6、11、15次和21次后,以冻融后的质粒标准品为模板同时进行real-time PCR扩增定量,比较量值变化。
高中值稳定,低浓度波动相对较大,高浓度质粒最大变化量为0.06个数量级;中浓度质粒最大变化量为0.18个数量级;低浓度质粒最大变化量为0.34个数量级。

扩展资料:
质粒DNA提取的要求规定:
1、以CaCl2沉淀法去除大分子RNA,Q-Sepharose和SOURCE两步离子交换层析法去除染色体DNA、小分子RNA、蛋白质等杂质。
2、有效去除质粒DNA制备过程中产生的杂质,可应用于药剂水平质粒DNA的制备。
3、L.P.Elwell的实验条件稍作改进,温和地制备清亮裂解液并抽提质粒DNA,应用Sephacryl S-1000作凝胶过滤,获得了纯度高、产量大,无染色体DNA。
参考资料来源:中国知网-反复冻融质粒标准品对荧光实时定量PCR实验的

可以通过紫外吸收检测。

因为核酸的最大吸收波长为260nm,蛋白质为280nm,在波长260nm时,1OD值相当于双链DNA浓度为50μg/ml,单链寡核苷酸的含量为30μg/ml,可以据此来计算核酸样品的浓度,还可通过测定在260nm和280nm得OD值的比值,估计核酸的纯度。

纯净DNA的比值为1.8, RNA为2.0。若比值高于1.8说明DNA样品中的RNA尚未除尽,若样品中含有酚和蛋白质将导致比值降低。

270nm存在高吸收表明有酚的干扰。 紫外分光光度法只能用于测定浓度大于0.25μg/ml的核酸溶液,对浓度更小的样品,可采用荧光分光光度法。

扩展资料:

在判断过程中,也有可能出现质粒DNA提取纯度失败的情况,具体可能是有以下几个原因:

1、菌体量可能过大,裂解不充分,或裂解液与中和液比例不适当;

2、混合时过于剧烈,可能会带来基因组DNA片段的污染;

3、Rnase失活,可能带来RNA污染;

4、离心不充分(有絮状物在上层),或在离心后吸取上清时,将沉淀吸入,会带来蛋白质污染.

参考资料来源:百度百科——质粒DNA纯化



1、用紫外分光光度计测浓度和纯度 2、跑电泳看条带

大提质粒和小提质粒的基本原理是一样的,都是通过一定的方法(如加碱裂解)使在细菌内大量扩增的质粒释放出来,然后经过去蛋白去RNA等一系列步骤纯化DNA,最终将DNA提取出来。区别:
1.大提用于大量菌液的提取,100ml-500ml 均可,而小提用的菌液量很少,一般1.5-5ml。
2.一般试剂盒中大提比小提多了溶菌酶、异丙醇(回收沉淀核酸)、含一定量PEG的氯化物(回收质粒DNA)及乙酸铵等,其作用及目的都是有利于细菌的裂解和质粒的纯化,所以大提的产物比小提的量多很多,而且纯度很高。
3.小提一般用于质粒鉴定和对纯度要求不是很高的实验,大提用于质粒的大量提取和转染等纯度要求很高的实验。

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