二级域名被百度惩罚，对主域名有影响吗

有一定的影响的，但是不是太大，主域名有一定的几率会被降权惩罚，但是如果你的主战没有采用特殊的手法操作，问题不大

二级域名相当于一个独立的新站，对主域名的影响甚微；不知你说的网站主域名权重上升具体是什么情况，如果只是一般意义上面的排名波动的话，我觉得这个是经常有的，基本可以排除二级域名对它的影响，而二级域名被惩罚，估计是里面有太多称之为垃圾的内容存在。