注册资本的印花税每年都要交还是只交一次

不是，交一次。
根据《国家税务局关于资金账簿印花税问题的通知》（国税发〔1994〕25号）第一条规定，生产经营单位执行“两则”后，其“记载资金的账簿”印花税的计税依据改为“实收资本”与“资本公积”两项的合计金额。适用税率为万分之五。
企业执行“两则”启用新账簿后，其“实收资本”和“资本公积”两项的合计金额大于原已贴花资金的，就增加的部分补贴印花。
如果仅变更税务登记证上的法人代表，实收资本与资本公积金额总和未变，不涉及缴纳印花税。

根据国税发[1991]155号文件规定，企业股权转让所立的书据，即除书立的A股、B股股权转让书据以外的股权转让合同，按照“产权转移书据”，按所载金额的万分之五缴纳印花税。
股东改变，就涉及到了股东股权转让，应缴纳万分之五的印花税。

　　注册资本不是每年交一次印花税，只有在注册资金发生增加变动时，才按增加的注册资金的万分之五计算交纳印花税。也就是说，注册资金不发生增加，就不交印花税。

　　股东投入的资本，就在投入时缴纳一次印花税就可以了。

法律分析：注册资本的印花税只需要交一次。生产经营单位执行“两则”后，其“记载资金的账簿”印花税的计税依据改为“实收资本”与“资本公积”两项的合计金额。适用税率为万分之五。如果仅变更税务登记证上的法人代表，实收资本与资本公积金额总和未变，不涉及缴纳印花税。股东改变，就涉及股东股权转让，应缴纳万分之五的印花税。

法律依据：《中华人民共和国印花税暂行条例》第四条　 下列凭证免纳印花税：（一）已缴纳印花税的凭证的副本或者抄本；（二）财产所有人将财产赠给政府、社会福利单位、学校所立的书据；（三）经财政部批准免税的其他凭证。第五条　 印花税实行由纳税人根据规定自行计算应纳税额，购买并一次贴足印花税票（以下简称贴花）的缴纳办法。为简化贴花手续，应纳税额较大或者贴花次数频繁的，纳税人可向税务机关提出申请，采取以缴款书代替贴花或者按期汇总缴纳的办法。