用自己合成的引物送到测序公司进行细菌基因组测序

kuaidi.ping-jia.net  作者:佚名   更新日期:2024-08-04
合成引物和测序引物

在高中教材上的PCR技术中就需要合成引物。而合成引物之前,当然需要测序引物。然后在化学合成什么的。测序引物分自带引物和通用引物,自带引物是自己设计的PCR上的某段序列或者是基因工程的载体上的某段序列、通用引物就是购买载体(简单点说就是用买来做实验的载体准备的几段附赠的测序引物。)测序必须为特异性引物,不能为随机、兼并、不纯、带荧光标记、长度过长引物。尤其是基因工程的引物。更加严格。长度要控制在15-30之间、而PCR的要求比较低,因为PCR仅仅是为了扩充已知序列、

测序一般一个反应在700bp左右,也就是说一个引物可以支持700bp长度的片段的测序工作,你自己设计的一对引物就是正反两方向测,大概在1400bp。

但是,一般测序公司测4kb的片段还是很容易的,因为只要拿到了第一个700bp,就可以在这个基础上再设计引物,进行下一段的测序工作。

可是,我想说的是,你扩不到片段是什么意思?是扩不出任何片段还是扩不出4kb的片段?你提的基因组有没有问题?引物有没有问题?

最后,找个华大或者英骏这样大一点的公司,建议提供菌液给他们。

序列太长了,需要测序公司给你在设计引物测。费用就比较贵了。基因组测序需要做二代测序,费用应该不便宜,也没必要。现在一代测序测不了。除非你自己把PCR扩出来测,任务量巨大,呵呵。

序列太长了吧,测序的可信区间只有800b左右,我的测序测到900多之后就全是杂峰了

  • 测序引物选择
    答:因为在引物下游几十个bp左右,测序的结果是不稳定的,往往测不出,需要几十个bp之后才稳定。你再看看你送的是质粒还是pcr产物,如果是质粒,就可以看看外源片段的上游有什么启动子或者通用的测序序列,一般的测序公司都是有自己设计的较好的通用测序引物,你可以用他们的(不用加钱)。你参考下这个文章...
  • T载上连接2000bp的目的片段,请问怎么测序,谢谢!!
    答:但是对应的两个末端的结果不太可靠,所以需要人为的选择、拼接一下,当然一些测序公司会根据测序的情况自动给你拼接好。如果不放心,可以直接选择“测通”,公司会在已经测出稳定结果的地方帮你再合成一条引物继续往前测,直到测到载体序列为止。2K的带,选双向测序,自己拼接一下就可以了。
  • ...百分之九十多都是载体序列另外还能找到自己的引物是怎么回事啊_百度...
    答:说实话,克隆时偶尔会出现一些难以理解的事情,我还遇到过引物序列不停重复然后插入到了载体上,遇到过只插入部分目的序列,还遇到过PCR出来有条带,测出来是空载。经验丰富的实验师也好,有名的大教授也好,也不知道这只偶然现象为什么会发生。
  • 想检测自己P53基因有没有缺失和突变是不是要做全基因测序,如果只查多态...
    答:只查P53是否缺失的话,只要用pcr检测就好了。如果你在实验室里的话,只要自己设计一对引物,取点口腔上皮细胞(用棉签刮一下),做个pcr,跑个胶,自己看一下就可以了。还要看是否突变的话,就要把整个基因扩增出来,送测序公司测序,然后blast一下。如果你不懂的话,当然最好是建议你找专门的机构...
  • 酵母菌是不是可以直接测序,不用提质粒
    答:你们是自己测序,还是送公司测序?如果是送公司的话,可以直接测序,测序引物为M13通用引物。但是测序之前需要把挑出来的克隆,扩繁、PCR检测后再测序。测序公司再提取质粒-测序。如果是自己测序,酶切应该是检测用,阳性的质粒再测序。总之,一般情况下,测序都是用质粒。酶切或者PCR只是用来检测阳性克隆,...
  • 微生物中存在一个有价值的基因怎么把它提取出来?
    答:再根据这个微生物基因组中这段基因上下游序列设计引物,用提取的gDNA作为模板进行PCR,顺利的话就可以扩增出来,最后将扩增产物跑电泳回收,送到测序公司测序,以确定是不是跟NCBI上一样的序列。这样就完成了基因的获取工作了。如果这个微生物的全基因组没有被测过的话,那你可以选择全基因组测序得到完成...
  • 自己设计的基因导入到载体后,扩增完成,用PCR检测和双酶切检测成功,但是...
    答:PCR检测和酶切检测成功的话,说明你确实插入东西了,你确定你这两种检测用的引物和酶都没问题吗?测序结果你是用正向引物测序的还是用的反向引物测序的,如果是反向引物的话,测序结果需要reverse complement以后再跟原始序列进行比较
  • 测序的引物该怎么选择
    答:如果你是质粒上通测的话,测序公司会用通用的引物。如果只是测片段的话,测序公司也会给合成引物的啊。
  • 设计克隆一个基因的CDNA序列的实验!注意是实验哦!周四之前!谢谢,满意...
    答:2,查阅一些文献,看要克隆的该基因在哪种组织里面表达量高。然后提取该组织或部位的RNA,反转录成CDNA。以CDNA作为模板进行PCR。3,跑电泳,若有单一且大小接近的条带,切胶回收。4,连接入质粒载体,送测序公司或自己测序,与近缘种内该基因比对后,便可确定该物种的该基因序列。
  • 表达载体测序的时候为什么需要引物呢。
    答:测序其实也是PCR反应,当然需要引物了,不过很多载体是公用的,测序公司有很多用于载体上测序的引物,你可以先打电话问一下测序公司有没有你要测的那个载体的引物,没有的话就自己提供或者让他们合成