DNA 提纯的方法
提取DNA主要有SDS和CTAB法，其实提取效果的好坏主要看提取的对象是什么样的材料，在提取之前一定要好好分析材料的特性，然后在设计实验步骤。
一）CTAB法
CTAB是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（0.7 mol/L NaCl）是可溶的，当降低溶液盐浓度到一定程度（0.3 mol/L NaCl）时，从溶液中沉淀，通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开，然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液，再加入乙醇使核酸沉淀，CTAB能溶解于乙醇。
（二）SDS法
利用高浓度的SDS，在较高温度（55—65℃）条件下裂解细胞，使染色体离析，蛋白质变性，释放出核酸，然后采用提高盐浓度及降低温度的做法使蛋白质及多糖杂质沉淀（最常用的是加入5M的KAc于冰上保温，在低温条件下KAc与蛋白质及多糖结合成不溶物），离心除去沉淀后，上清液中的DNA用酚/氯仿抽提，反复抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。
以下是在提取热带水果DNA时设计的两种不同方法步骤，对比起来CTAB法好，在禾本科植物效果差不多！
1、 CTAB法
1） 在所需量的CTAB抽提液中加入2－巯基乙醇，使终浓度达2％（v/v）。将此溶液预热至65℃。
对于每克新鲜的叶组织大约需要4ml的2－ME/CTAB抽提液。
2） 用液氮（－196℃）或干冰（－78℃）冷却粉碎器/匀浆器，将0.5 g植物组织粉碎成细粉，然后将组织转移到2.0 ml离心管。
3） 加入800 µl预热的2－Me/CTAB，混合使之充分湿润，于65℃温育20 min，不时颠倒混匀。
4） 待冷至室温后，加入800 µl氯仿/异戊醇（24：1），颠倒混匀至溶液呈乳浊状----但不要振荡。25℃，10000 rpm离心10 min。
5） 上清（~700 µl）转移至另一干净的离心管中，加入5 µl RNaseA贮液，37℃温育30 min。
6） 加入700 µl氯仿/异戊醇，颠倒混匀，25℃，10000 rpm离心10 min。
7） 上清（~600 µl）转移至另一干净的1.5 ml离心管中，加入600 µl异丙醇，颠倒混匀，室温或-20℃放置20 min。
8） 25℃，12000 rpm，离心10 min，收集沉淀。
9） 去上清，加1 ml70%乙醇洗涤沉淀两次。（25℃，12000 rpm，离心10 min）
10）凉干DNA，溶于50 µl ddH2O，4℃保存备用。
2、 SDS法
① 将0.3 g植物材料于液氮速冻，然后在研钵中将其磨碎，将粉末转至2 ml离心管中。
② 加入1.2 ml预热至65℃的提取缓冲液（其中加入3 μl β—巯基乙醇，增加DNA的稳定性），置65℃水浴中放置30分钟，不时颠倒混匀。。
③ 加入0.45 ml 5M的醋酸钾，混匀，冰浴20分钟，在10000 rpm离心20 min。需要的话，Miracloth纱布过滤除去沉淀，上清液转入另一离心管中。
④ 加入等体积氯仿：异戊醇（24：1），轻轻颠倒混匀，12000 rpm离心15 min。
⑤ 转移上清液到另一新离心管中，加5 μl RNaseA贮液，37℃温育30 min。
⑥ 加入等体积氯仿：异戊醇（24：1），轻轻颠倒混匀，12000 rpm离心15 min。
⑦ 转移上清液到另一新离心管中，加入0.7V异丙醇，轻轻颠倒混匀，-20℃放置30分钟沉淀核酸。
⑧ 25℃，12000 rpm，离心10 min，收集沉淀。
⑨ 弃上清，70％乙醇洗两次。
⑩ 凉干DNA，溶于50 µl ddH2O，4℃保存备用。
检测：用足迹法，又称为足印法（footprinting）是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。其原理为：DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解，在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区)，从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后，又可测出被结合处DNA的序列。 纯化：蛋白质和dna均可用电泳方法进行分离纯化。 DNA带负电，电泳向正极移动，由于不同DNA片段的大小不同，所以电泳时移动速度不同。因此可以分离。不同的蛋白质在不同的缓冲液中所带电荷一般不同，分子质量也一般是不同的，因此利用以上两方面的差别，电泳时不同蛋白质移动方向，移动速度不同，可以彼此分开。
一.酚抽提法：先用蛋酶K、SDS破碎细胞，消化蛋白，然后用酚和酚-氯DNA大小为100-150kb二.甲酰胺解聚法：破碎细胞同上，然后用高浓度甲酰胺解聚蛋白质与DNA的结合，再透析获得DNA可得DNA200kb左右。
三.玻璃棒缠绕法：用盐酸胍裂解细胞，将裂解物铺于乙醇上，然后用带钩或U型玻璃棒在界面轻搅，DAN沉淀液绕于玻棒。生成DNA约80kb。
四.异丙醇沉淀法：基本同1法，仅用二倍容积异丙醇替代乙醇，可去除小分子RNA（在异丙醇中可溶状态）
五.表面活性剂快速制备法：用Triton X-100A或NP40表面活性剂破碎细胞，然后用蛋白酶K或酚去除蛋白，乙醇沉淀或透析。
六.加热法快速制备：加热96℃-100℃，五分钟，然后离心后取上清，可用于PCR反应。
七.碱变性快速制备：先用NaOH作用20分钟，再加HCI中和，离心后取上清，含少量DNA。
名词解释：
DNA
DNA，全称Deoxyribonucleic acid，中文名为脱氧核糖核酸，是一种长链聚合物，组成单位称为四种脱氧核苷酸，由碱基，脱氧核糖，磷酸组成。DNA是染色体的主要化学成分，同时也是基因组成的，有时被称为“遗传微粒”。DNA是一种分子，可组成遗传指令，以引导生物发育与生命机能运作。主要功能是长期性的资讯储存，可比喻为“蓝图”或“食谱”。其中包含的指令，是建构细胞内其他的化合物，如蛋白质与RNA所需。带有遗传讯息的DNA片段称为基因，其他的DNA序列，有些直接以自身构造发挥作用，有些则参与调控遗传讯息的表现。
物理性质
DNA
DNA是高分子聚合物，DNA溶液为高分子溶液，具有很高的粘度，可被甲基绿染成绿色。DNA对紫外线（260nm）有吸收作用，利用这一特性，可以对DNA进行含量测定。当核酸变性时，吸光度升高，称为增色效应；当变性核酸重新复性时，吸光度又会恢复到原来的水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性，即DNA双链碱基间的氢键断裂，双螺旋结构解开—也称为DNA的解螺旋。
加入2MOL/L的氯化钠溶是DNA的溶解度达到最大,此时过滤已经将杂质滤去。调节溶液到0.14MOL/L析出DNA这个地方再过滤，就只过滤出DNA
