谁能具体解释一下荧光定量PCR中溶解曲线的意思以及作用

kuaidi.ping-jia.net  作者:佚名   更新日期:2024-07-23
谁能具体解释一下荧光定量PCR中溶解曲线的意思以及作用

荧光定量pcr的溶解曲线理解:用Syber Green方法做完PCR后,用来判断产物是否相对专一。应结束后,逐渐加温。和SyberGreen分子结合的PCR产物随温度升高逐渐变为单链,就不能在和SyberGreen结合。
出现怪异的溶解曲线大部分都是机器设置或者反应体系的问题,建议:
1、将扩增产物跑一下电泳,看一下目的条带亮不亮
2、一般定量PCR扩增后目的片段的峰在80~90℃之间,反应条件确认一下设置是否有问题
3、适当增加模板量或者减少引物浓度。

技术原理
将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光;
随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。
以上内容参考:百度百科-实时荧光定量PCR

这个用于Syber Green实时PCR。而使用探针的不需要。

因为Syber Green是非特异性结合,所以如果有非特异性的序列被扩增,也会同样产生信号。在设计引物的时候,可以计算出被扩增序列的Tm。PCR反应完成以后,开始进行解离曲线的测量。一般是对反应产物逐步加温,每增加一度,测信号一次。PCR产物会在温度达到TM时发生解离,荧光信号会一下子消失、如果把温度和荧光信号的变化做一个图,就会看到一开始,荧光信号没有变化,是一个平直的线。达到TM附近是,会有一个比较锐利的峰,说明信号的变化很大,继续加热超过TM,这是双链都打开了。所以信号也不会再有变化,所以又是平直的线。

如果产物都是特异性的,就是我上面说的那样。如果有非特异性产物,就会出现不在TM就出现峰值,或者有矮而胖的峰值等等异常情况出现,这样,那个管子的样本就不能用了。

溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线,类似于电泳。那么你扩增几种基因就应该有几种对应的峰(一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间),我说的是一般情况,这个跟扩增片段长短有关系。出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般为60~75℃之间)视引物长度而定,而基因组DNA污染的峰会在90℃以后。出现引物二聚体可能是引物设计、引物加量等原因(也有可能是从加完反应液到上机开始PCR这之间的时间过长)所致;基因组DNA那么考虑设计跨内含子引物或者实验之前做gDNA的消除工作。而阴性对照有目的峰那可能就是模板污染,注意实验操作等避免模板污染。 详细请见我的回答:

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