多年前在农村耕地里种植了树木，随后在林业部门申请了相关的证件，树木成材后，将其砍伐，是违法行为吗？

是违法行为。

1、根据《土地法》第三十六条规定：“非农业建设必须节约使用土地，可以利用荒地的，不得占用耕地；可以利用劣地的，不得占用好地。
禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。 

禁止占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼。

据此，在耕地里种植树木是违法的，依法应由乡镇人民政府或者土地部门给予处罚。
2、根据《森林法》第三十二条规定：采伐林木必须申请采伐许可证，按许可证的规定进行采伐；农村居民采伐自留地和房前屋后个人所有的零星林木除外。 国有林业企业事业单位、机关、团体、部队、学校和其他国有企业事业单位采伐林木，由所在地县级以上林业主管部门依照有关规定审核发放采伐许可证。 

铁路、公路的护路林和城镇林木的更新采伐，由有关主管部门依照有关规定审核发放采伐许可证。 农村集体经济组织采伐林木，由县级林业主管部门依照有关规定审核发放采伐许可证。 农村居民采伐自留山和个人承包集体的林木，由县级林业主管部门或者其委托的乡、镇人民政府依照有关规定审核发放采伐许可证。 采伐以生产竹材为主要目的的竹林，适用以上各款规定。

扩展资料

案例

2015年5月，城管马连洼队接到其他部门移交案件，称位于海淀区天秀花园安和园小区，有树木被非法砍伐。

随后，记者与城管执法人员一同来到现场，伐树地点位于小区内的一片绿化地。经执法人员现场仔细检查、勘验，共发现地径从不足10余厘米到20余厘米不等的7棵树木被砍伐，而被砍伐的树木也不止一个品种，通过在场的保洁绿化部门工作人员的初步确认，有白蜡、柳树、油松、千头椿和紫叶李等不同树木。记者现场看到砍伐后的树桩并未进行任何处理，秃伶伶的立在地面上。

经过城管执法人员的走访调查，小区物业部门承认了砍伐树木行为。小区工作人员告诉记者：“当时砍伐树木时感觉树木已经死亡了，所以就对小区中的‘死树’进行了砍伐。”当执法人员问及是否办理了砍伐许可证时，物业工作人员表示，并不知道砍伐死树还需要办理证件。此时一位买菜归来的小区居民路过此处并向记者表示：“这些被砍伐后的树木的根部还留在那里，孩子们在此玩耍，特别容易被绊倒。”

城管执法队员告诉记者：根据《北京市绿化条例》的相关规定，严格控制砍伐树木，对于已经死亡的树木，经批准后才可以砍伐。而物业公司私自砍伐树木，并未办理砍伐许可证，已违反了《北京市绿化条例》的规定属于未按规定砍伐树木的行为。由于此伐树时间属于行政法规2年追诉时效期内，城管将进一步对此案进行调查，该小区物业公司将面临规定地点补种砍伐株数10倍的树木，同时并处所砍伐树木价值5至10倍的罚款。

参考资料来源：人民网——物业私自伐树  城管予以查处